本詞典的書寫系統採用教育部與原住民委員會於民國94年12月15日公告實施之「原住民族語言書寫系統」。按此，賽德克語德固達雅共有18個輔音(含2個半元音)及5個元音，都達、德路固兩個方言所使用的書寫符號大部分相同，元音皆是五個，元音e 則因方言發音不同分別代表[e][ə]，輔音在書寫符號g、j(/ɟ/)之使用，亦略有差異。德固達雅語的音域中並沒有[j]或[z]，僅在外來語借字(日語、漢語或閩南語)的情況之下，才會使用，例如bozu “光頭”或ajimoto “味精”。

字詞之重音，有規則落在倒數第二個音節，書寫時無需標示重音，如果後加詞綴，重音也會轉移到新詞的倒數第二音節，倒數兩個音節之所有元音皆需書寫，非後兩音節之元音有弱化或同化現象。所有未書寫之元音的讀音均是可預測的中性元音[u]。在輔音[h]前後的元音遵守所謂的元音和諧規則，即未書寫之元音與重音節之元音同音讀，例如，khei “結果實”，正確讀音為[kehei]，shilo “蓋”，正確讀音為[sihilo]，yhani“為某事而來” 正確讀音為[yahani] 。為了瞭解借字的原貌，借字所有音節的元音皆需書寫。

後加詞綴情況下，元音為字頭(非重音之處)全有規律脫落，如yah-un (eyah) “來”; cux-un (icux) “攪動”; sa-un (osa) “去”; ngal-an (angal) “拿”。例字出現兩個元音如seeru “分食”、paadis “託人帶”、muudus “活的”、siimah “喝”、soora “羨慕”，並非複合元音，亦不表長音，而是分屬不同音節之元音，此倒數第三個音節之元音則需書寫。漢語/日語/閩南語之借字，所有音節之元音亦全書寫出來，例如ajimoto “味精”。重音出現的e三個方言之間，書寫上略有差異，重音出現的e ([e])，在Tgdaya，需書寫出來，在Toda和Truku，根據族人內部之共識，重音e ([ə])出現在字首時需書寫，若在非字首，則有規律省略不寫。Tgdaya的lexi “竹筍”在Toda和Truku則書寫成lxi。

賽德克語共有7個塞音，分別以字母p、b、t、d、k、g、q代表。只有q沒有相對的小舌濁塞音。根據楊秀芳(1976)和Li (1977)、李壬癸(1991)的研究，Tgdaya的[b]/[p]/[m]三個輔音不出現在字尾，三個唇音全有規律的變成舌根音[k]/[ŋ]，若加上後綴，[b]/[p]/[m]會復原，例如meluk “關”，加上後綴 -un (leb-un) 原音素/b/復原，atak“剪”，加上後綴 -un (tap-un) 原音素/p/復原，tmalang“跑”，加上後綴 -an (tlam-an) 原音素/m/復原。Tgdaya的[g]輔音在字尾時會脫落，加上後綴，[g]會復原，例如 asuw “分給” 對應p-sug-i，baro “長; 上面” 對應k-brag-an。非字尾的[g]輔音，例如gisu “來” hlagi “蓋被子”，眉溪部落族人比較會用[w]isu、hla[w]i，這點跟Toda/Truku方言很接近。

字尾的舌尖塞擦音c [ts]的演變頗複雜，部分c是來自原本詞根就是c，例如bcebac “剖切” 對應bcbac-an/bcbac-un，部分字尾c是由t或d變化而來，加上後綴，原音素/t/或/d/會復原，例如hemuc “隨便” 對應mhmet-an，harac “築牆” 對應hnrad-an/hrad-un，hanguc “煮” hnged-an，部分字尾c加上後綴，連同前面元音會一起脫落，例如haduc “送(人到某地) ” 對應had-un/had-an/had-o。

l與r(/ɾ/)分別代表舌尖邊音及舌尖閃音。根據李壬癸(1991)，r(/ɾ/)是一個發音部位較/l/為後的舌尖拍音(tap)，當r(/ɾ/)出現在字尾時通常保持拍音姿勢，舌尖不放下，如 bgihur風”。字尾的l與r，年輕一輩逐漸唸成n，例如: kingal “一”: kingan，bicur “蚯蚓”: bicun，這些例字音變記載在變體詞項中。

字母w與y分別代表唇音半元音及舌面半元音/w, y/。半元音/w, y/可出現在音節首，如wawa “泛稱幼獸、yayu “小刀”。半元音/y/亦可與元音a, e, o, u連用，成為複合元音，如tutuy “起來”。